Ha pasado un año desde que Sally se casó con su querido Jack Skelleton y asumió su papel como reina de la ciudad de Halloween. Pero, aunque Jack está a su lado, gobernar no es tarea fácil, y Sally se siente insegura sobre su futuro. Sus costuras están al límite entre las obligaciones reales, su nueva familia y el deseo de unir a los ciudadanos de todas las tierras de Hinterland.
De repente, una sencilla demostración de pociones durante la Exposición de Halloween inaugural de Sally sale terriblemente mal, y todo se desmorona rápidamente: Sally y su nueva aprendiz de trapo, Luna, caen por un misterioso portal que las lleva a un nuevo reino llamado ciudad del Tiempo. Pronto descubren que alguien ha manipulado el reloj que controla la ciudad de Halloween, por lo que Sally no puede regresar a la versión actual de su hogar a menos que encuentre al culpable y restablezca el tiempo.
Sally y Luna emprenden un viaje para descubrir la verdad, encontrándose por el camino con nuevos pueblos, amigos y enemigos. Pero el tiempo corre, y mientras Sally lucha por salvar a Jack y su hogar, se pregunta qué tipo de futuro desea realmente... y qué tendrá que sacrificar para conseguirlo.
